Le jeune défenseur de 18 ans va dans un premier temps évoluer avec les U21 du club campinois.
Ebenezer Agyei n'aura pas mis beaucoup de temps pour convaincre Westerlo se l'engager. Comme le rapporte la DH, le frère jumeau d'Enock Agyei a signé pour Westerlo après quelques jours d'entraînement à peine et quinze minute disputées lors d'un match amical face au RWDM.
Ebenezer aurait pourtant pu choisir une autre voie et rejoindre son frère à Burnley mais il a refusé l'offre du club anglais dirigé par Vincent Kompany. C'est au Sporting d'Anderlecht qu'Ebenezer a été formé, après des débuts à Verviers, sa ville de naissance. après un à Anderlecht depuis le début de son adolescence après avoir été repéré très jeune au CS Verviers. C'est d'ailleurs au RSCA qu'il avait signé son premier contrat professionnel en 2020.